扬州市中医院始建于1978年，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、文化宣教于一体的国家三级甲等中医医院，是南京中医药大学附属医院、扬州大学临床中医学院，国家首批中医住院医师、全科医师规范化培训基地，全国首批中医诊疗模式19家创新试点单位之一，江苏省中医药文化宣传教育基地，扬州市中医药适宜技术培训基地、扬州市肿瘤诊疗中心和扬州市颈肩腰腿痛一体化诊疗中心。
2019年医院门诊量54.36万人次，中医诊疗51.81万人次，中医药业务收入10095.76万元，中草药收入5295.54万元，中成药收入2763.62万元，中药收入占药品收入53.37%；中医非药物疗法收入2036.61万元，中医收治住院病人19478人。
医院占地面积3.2万平方米，总建筑面积5.81万平方米，编制床位700张，实际开放床位588张。现有职工706名，拥有全国名中医药专家传承指导老师2名，23人获国家、省、市级人才培养及资助项目，其中国家级5人、省级5人、市级13人，省市名中医19名，全国优秀中医临床人才1名，江苏省优秀中医临床人才培养对象1名，江苏省中医药领军人才培养对象1名，江苏省“333”工程培养对象2名，医学博士11名，在读博士4名，硕士123名，高级职称人员156名，研究生导师14名。全院中医药人员（含返聘）244人，中医166人，中药31人，其中，正高44人，副高42人，中级74人，初级84人，博士10人，在读4人，硕士81人，本科116人。
医院设有扬州市名医馆及急诊、内、外、妇、儿、骨伤、针灸、肿瘤等一级临床科室22个，心病科、脾胃病科、肺病科、脑病科、泌尿外科等二级专科33个，常年开放专科专病门诊91个。其中，肿瘤科是国家临床重点专科、国家中医药管理局重点专科、省中医药重点学科、扬州市“科教兴卫”工程医学重点学科；骨伤科、脑病科、肺病科、脾胃病科是省级中医重点专科；肾病科、泌尿外科、针灸科、心病科、耳鼻喉科是市级重点专科；中医肺病学、针灸学、中医脾胃病学、中医脑病学为市级中医药重点学科。“然”字门内科、“谦”字门儿科、“春”字门内科和“朱氏”针法为江苏省非物质文化遗产保护项目，“王氏伤科”、“卞氏眼科”为扬州市非物质文化遗产保护项目。 医院拥有128排256层CT、1.5T核磁共振、DSA、直线加速器等大中型诊疗设备200余台套。设立影像科、医学检验科、核医学科、病理科、超声诊断科等医技科室，常规开展检查检验和介入放疗等工作。中药房常备中药饮片550种，诸多院内制剂来源于名老中医及专家的验方、秘方，现有批准文号的院内制剂44种，其中中药制剂27种，临床疗效显著。
医院拥有江苏省名老中医药专家传承工作室4个，中医门派传承工作室8个，扬州市名师工作室6个，域外名中医工作室15个，一批中医临床骨干拜师学艺，传承名老中医临床诊疗经验，为名医成长奠定基础。
随着医改工作的推进，医院牵头成立拥有14家成员单位的扬州市中医院医疗联合体，成立扬州市中医专科联盟，向医联体成员单位常规派出专家和管理人员，开展专家坐诊、教学查房、业务培训、健康宣教、管理帮扶、科室共建、双向转诊等工作，提升基层医疗机构服务能力，扩大中医药服务影响。
